Sensitivity of African swine fever surveillance system for wild boar in Estonia
Date
2022Embargo Lift Date
09.09.2022Author
Breukers, Eveliina Anni Maria
Metadata
Show full item recordAbstract
African swine fever is a viral disease of domestic pigs and wild boar, causing huge economic
losses in pig industry. The main aim of the study was to investigate the sensitivity of African
swine fever surveillance system implemented for wild boar in Estonia on county level, based
on ASF surveillance data from Estonian Veterinary and Food Authority. More specifically,
the study wanted to assess if the number of sampled wild boar is sufficient to detect ASF in
counties, where ASF positive animals have not been detected and what is the confidence of
disease freedom in counties where ASF positive cases have not been detected over longer time
periods. The data was analysed from 15 Estonian counties from 2018 to 2021. In total 26 449
wild boar samples were analysed. The data was analysed in EpiTools by using “Simple riskbased surveillance - calculation of surveillance sensitivity” calculator to calculate the
surveillance system sensitivity on single county level for every year of the study period and
then “Confidence of population freedom for multiple time periods” calculator was used to
calculate the confidence of freedom for single and multiple time periods in every county using
the outputs from sensitivity analysis. The results indicated that 64.8% of the time periods, the
surveillance sensitivity reached the sufficient level (>95%). Simple cumulative confidence of
freedom was sufficient (>95%) for 75.9% of the time periods and reached >95% by the end
of the whole observation period for all counties, whereas equilibrium cumulative confidence
of freedom, which is dependent on probability of introduction (set at 10%), didn’t reach
sufficient level in any time period being 90% at maximum. Sigade Aafrika katk (SAK) on kodu- ja metssigade viirushaigus, mis põhjustab seakasvatusele
suurt majanduslikku kahju. Töö põhieesmärk oli uurida metssigade Aafrika seakatku
seiresüsteemi tundlikkust maakonna tasandil Eestis Veterinaar- ja Toiduameti seireandmete
põhjal. Täpsemalt sooviti uuringuga hinnata, kas uuritavate metssigade arv on piisav SAK-ii avastamiseks ning millise usaldusnivoo juures oli taudivabadus tõendatud maakondades, kus
SAK viiruspositiivseid metssigu ei tuvastatud pikema ajaperioodi vältel. Analüüsiti andmeid,
mis pärinesid perioodist 2018-2021 kõikidest Eesti maakondadest. Kokku analüüsiti andmeid
26 449 metssea kohta. Andmeid analüüsiti veebipõhise arvutitarkvara EpiTools abil. Esmalt
arvutati seiresüsteemi tundlikkus igas maakonnas iga uuringuperioodi aasta kohta ning nende
tulemuste põhjal taudivabaduse usaldusnivoo iga aasta kohta ning kumulatiivselt kogu
vaatlusperioodi kohta. Tulemused näitasid, et kõikide maakondade peale kokku oli aastas
kogutud proovide arv maakonnas piisav saavutamaks 95% või suurem seire süsteemi
tundlikkus 68,4% juhtudel. Lihtne kumulatiivne usaldusnivoo taudivabaduse suhtes oli piisav
(>95%) 75,9% juhtudel ja saavutas piisava taseme kogu vaatlusperioodi lõpuks kõikides
maakondades, samas kui taudivabaduse balansseeritud usaldusnivoo, mis sõltub nakkuse
sissetoomise tõenäosusest, ei saavutanud ühelgi ajaperioodil piisavat taset olles maksimaalselt
90%.