Sigade Aafrika katku viiruse leviku kiiruse kirjeldus ja sõltuvus keskkonna temperatuurist Eesti metssigadel

Abstract

Sigade Aafrika katk (SAK) on liigispetsiifiline DNA viirushaigus, mis tabandab Eestis nii mets- kui ka kodusigu. Lisaks viiruse kolmele varasemalt kirjeldatud elutsüklile (silvaatiline, puugi-sea ja kodutsükkel) on hiljuti kirjeldatud ka neljas, metssigade elukeskkonnast sõltuv tsükkel, milles peetakse oluliseks ülekandeteeks metssigade korjuseid ja nende lagunemisprotsessi. Kuna viimane on seotud kliimatingimustega, siis SAK-i leviku seiramine metssigadel meteoroloogiliste andmete põhjal on oluline, seda enam, et keskkonnategurite mõju on SAK-viiruse levikule seni vähe uuritud. Töö on seotud varasemate raadiuse suurenemist kirjeldavate uurimustega. Uurimistöö eesmärk on kirjeldada SAK-viiruse leviku võimalikke mustreid. Töös on kasutatud 36-ilmajaama vaatlusandmeid, mis on asukoha ja kuupäeva põhjal pandud vastavusse SAK-positiivsete metssigade andmetega, saadud aegrida analüüsiti hooajalisusele ning koostati ARIMA-mudelid keskkonnategurite mõju hindamiseks, lisaks hinnati GARCH-mudeliga ka volatiilsust. Käesoleva töö tulemuste põhjal ei suuda keskväärtust eeldavad mudelid hästi kirjeldada Eestis 2014–2017 tuvastatud SAK antigeen- ja/või antikehapositiivsete metssigade andmeid, kuid tõenäoliselt mõjutasid positiivne temperatuur ja lumepaksus SAK-i levikut positiivses suunas, sademete puhul jäi mõju suund selgusetuks. Raadiuse muutusega SAK-i leviku kiiruse hindamine näib olevat märkimisväärselt volatiilne ning seega on tõenäoline, et nakkuse leviku kiirenemisel või aeglustumisel (paigalseis) toimub see muutus pikema ajaperioodi jooksul. Lühiajalised järsud muutused (šokid) ei oma tõenäoliselt levikukiirusele suurt mõju. Täpsemaks SAK-i leviku kiiruse mustrite kirjeldamiseks oleks tarvis edaspidistel uuringutel arvesse võtta potentsiaalset mõju omavaid keskkonnategureid.

African swine fever (ASF) is a viral, species-specific DNA disease that affects both wild boars and domestic pigs in Estonia. In addition to the three previously described life cycles of the virus (sylvatic, tick-pig, domestic), a fourth cycle depending on wild boar habitat involving carcasses and decomposition process has recently been described. The decomposition of carcasses is dependent on climatic factors but so far there are only limited studies taking environmental factors into account in ASF spread. This paper is related to previous studies describing velocity of ASF spread using radius expansion method. The aim of the study is to describe possible patterns of ASF virus spread. Observational data from 36 weather stations was used, matched with the data of antigen and/or antibody positive ASF wild boars. ARIMA and GARCH models were applied to the time series. It appears that models which expect mean value to exist in data, cannot fully describe the ASF spread in Estonia between 2014–2017. The results however suggest that positive temperature and snow thickness probably affected the spread rate in a positive direction, in the case of precipitation the direction of the effect remained unclear. Estimation of spread rate with radius change appears to be volatile, and thus it is likely that if a change will occur, then it will take a long period of time to reverse to mean value. Short-term abrupt changes (shocks) are unlikely to have a major impact on the rate of spread. Future studies should consider taking into account potential environmental factors in order to describe the rate of spread of ASF more accurately.