Associations between Giardia infection and faecal microbiota in calves
Laen...
Kuupäev
2023
Kättesaadav alates
08.09.2023
Autorid
Ajakirja pealkiri
Ajakirja ISSN
Köite pealkiri
Kirjastaja
Eesti Maaülikool
Abstrakt
Giardia duodenalis (synonyms G. lamblia and G. intestinalis) is a gastrointestinal protozoan
parasite prevalent worldwide. Giardiasis causes diarrheal disease in calves, other animals and
humans. Young animals and humans tend to be more prone for clinical Giardia infection.
Giardia spp. assemblages A and B have wider host range and are potentially zoonotic, while
rest six out of eight assemblages (C-H) are more species specific. Association with Giardia
infection and changes in gastrointestinal microbiota has been established in mice, dogs, and
children. Giardia has been reported in bovine animals worldwide, but its effect on
gastrointestinal microbiota and vice versa has not been widely studied. This thesis studied
the prevalence of Giardia infection and the possible association with faecal microbial changes
in three-week-old dairy calves in South-East Estonian farm. Faecal swabs and faecal samples
of 62 calves were collected 21 days after birth. Bacterial DNA was sequenced from the fecal
swab samples and immunofluorescein staining method was used for faecal samples for
Giardia oocyte detection. Positive Giardia infection was considered when at least one oocyte
was present in the faecal sample. Out of 62 calves, 20 (32%) were positive for Giardia
infection. Five bacterial phyla were identified, and the faecal microbiota composition was
found to be different during Giardia infection when compared to Giardia free calves,
establishing an association between Giardia infection and faecal microbiota in three-weekold dairy calves.
Giardia duodenalis (sünonüümid G. lamblia ja G. intestinalis) on kogu maailmas levinud seedetrakti parasiit, algloom. Giardiaas põhjustab vasikate, teiste loomade ja inimeste kõhulahtisust. Noortel loomadel ja inimestel on kalduvus kliinilisele Giardia infektsioonile. Giardia spp. genotüüpidel A ja B on laiem peremeeste ring ja need võivad olla zoonootilised, samas kui ülejäänud kuus genotüüpi (C-H) on liigispetsiifilisemad. Hiirtel, koertel ja lastel on leitud seos Giardia infektsiooni ja seedetrakti mikrobiota muutuste vahel. Giardia-t on raporteeritud veistel ülemaailmselt, kuid selle mõju seedetrakti mikrobiotale (ja vastupidi) pole laialdaselt uuritud. Käesolevas lõputöös uuriti Giardia nakkuse levimust ja võimalikku seost rooja mikrobioota muutustega kolmenädalastel piimavasikatel ühes farmis KaguEestis. Kokku 62 vasika pärasoolest koguti tampooni- ja roojaproovid 21 päeva pärast sündi. Rooja tampooniproovidest sekveneeriti bakteriaalne DNA, ja roojaproovidest Giardia ootsüstide tuvastamiseks kasutati immunofluorestseiini värvimismeetodit. Giardia positiivseks loeti proovi siis, kui leidus vähemalt üks ootsüst. Ühtekokku leiti 20 (32%) vasikat, kes olid Giardia infektsiooni suhtes positiivsed. Tuvastati viis bakteriaalset sugukonda, ja leiti, et rooja mikrobioota koostis erines kui võrreldi Giardia positiivseid vasikaid Giardia vabade vasikatega; seega tuvastati seos Giardia nakkuse ja rooja mikrobioota vahel kolmenädalastel piimavasikatel.
Giardia duodenalis (sünonüümid G. lamblia ja G. intestinalis) on kogu maailmas levinud seedetrakti parasiit, algloom. Giardiaas põhjustab vasikate, teiste loomade ja inimeste kõhulahtisust. Noortel loomadel ja inimestel on kalduvus kliinilisele Giardia infektsioonile. Giardia spp. genotüüpidel A ja B on laiem peremeeste ring ja need võivad olla zoonootilised, samas kui ülejäänud kuus genotüüpi (C-H) on liigispetsiifilisemad. Hiirtel, koertel ja lastel on leitud seos Giardia infektsiooni ja seedetrakti mikrobiota muutuste vahel. Giardia-t on raporteeritud veistel ülemaailmselt, kuid selle mõju seedetrakti mikrobiotale (ja vastupidi) pole laialdaselt uuritud. Käesolevas lõputöös uuriti Giardia nakkuse levimust ja võimalikku seost rooja mikrobioota muutustega kolmenädalastel piimavasikatel ühes farmis KaguEestis. Kokku 62 vasika pärasoolest koguti tampooni- ja roojaproovid 21 päeva pärast sündi. Rooja tampooniproovidest sekveneeriti bakteriaalne DNA, ja roojaproovidest Giardia ootsüstide tuvastamiseks kasutati immunofluorestseiini värvimismeetodit. Giardia positiivseks loeti proovi siis, kui leidus vähemalt üks ootsüst. Ühtekokku leiti 20 (32%) vasikat, kes olid Giardia infektsiooni suhtes positiivsed. Tuvastati viis bakteriaalset sugukonda, ja leiti, et rooja mikrobioota koostis erines kui võrreldi Giardia positiivseid vasikaid Giardia vabade vasikatega; seega tuvastati seos Giardia nakkuse ja rooja mikrobioota vahel kolmenädalastel piimavasikatel.
Kirjeldus
Final Thesis
Curriculum in Veterinary Medicine
Märksõnad
magistritööd, Giardia duodenalis, G. intestinalis, G. lamblia, master thesis, calf, faecal microbiota