Andmebaasi logo

VLI lõputööd

Selle valdkonna püsiv URIhttp://hdl.handle.net/10492/2470

Sirvi

Sirvi VLI lõputööd Märksõna "16S rRNA" järgi

Nüüd näidatakse 1 - 1 1
  • Pisipilt
    Kirje
    Cryptosporidium spp. infektsiooni ja rooja mikrobioota seos vasikatel
    (Eesti Maaülikool, 2026) Kaademäe, Desiree; Orro, Toomas (juhendaja); Dorbek-Sundström, Elisabeth (juhendaja)
    Soole mikrobioota mängib olulist rolli peremeesorganismi tervises ning võib mõjutada vastuvõtlikkust sooleinfektsioonidele. Siiski on mikrobioota koostise ja krüptosporiidide vahelisi seoseid endiselt ebapiisavalt kirjeldatud ning ravivõimalused piiratud. Käesoleva uurimistöö eesmärk oli hinnata soole mikrobioota koostise seost krüptosporidioosi esinemisega piimatõugu emastel vasikatel 2. elunädalal. Uuringusse kaasati 62 roojaproovi 7-päevastelt ja 61 proovi 10-päevastelt vasikatelt. Mikrobioota koostis määrati 16S rRNA geeni sekveneerimisanalüüsiga ning parasiidi esinemine tuvastati immunofluorestentsmeetodiga. Bakterisugukondade ja nakkuse vaheliste seoste hindamiseks kasutati logistilise regressiooni mudelit ning hõimkondade tasemel negatiivse binoomjaotusega regressioonmudelit. Mudelite prognoosivõimet hinnati ROCanalüüsiga. Krüptosporidioosi esinemissagedus oli 7-päevastel vasikatel 45,2% ja 10-päevastel 47,5%. Domineerivad bakterihõimkonnad mõlemas vanuserühmas olid Firmicutes, Actinobacteriota, Bacteroidota ja Proteobacteria. Hõimkonna ja sugukonna tasemel puudusid statistiliselt olulised erinevused krüptosporidioosiga vasikate ja kontrollgruppide vahel. Samuti ei leitud olulisi erinevusi Firmicutes’e ja Bacteroidota suhtes. Samas näitas 10. elupäeva mudel kõrgemat prognoosivõimet (kõveralaune pindala, AUC = 0,81) võrreldes 7. elupäeva omaga (AUC = 0,71). Tulemused viitavad, et vasikate vastuvõtlikkus on seotud soole tervikliku mikrobioota koostisega, mitte spetsiifiliste bakterisugukondadega.